Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms