Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nccrp1G3X9C2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms