Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms