Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc9a3G3X939 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms