Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms