Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms