Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21974F6W3F3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms