Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sptbn5F6UCX4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms