Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syngap1F6SEU4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms