Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cald1E9QA15 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cald1E9QA15 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms