Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms