Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L7

Gm20715, Predicted gene 20715, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20715E9Q3L7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20715E9Q3L7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20715E9Q3L7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms