Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms