Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3250E9Q1M3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3250E9Q1M3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3250E9Q1M3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3250E9Q1M3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3250E9Q1M3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3250E9Q1M3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3250E9Q1M3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3250E9Q1M3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3250E9Q1M3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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