Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3893E9Q1I1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3893E9Q1I1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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