Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4930426L09RikE9Q0N7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms