Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdr1E9Q0B4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdr1E9Q0B4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms