Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gcom1E9PZ54 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gcom1E9PZ54 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms