Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sfta2E9PXB6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms