Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms