Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms