Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms