Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
3425401B19RikD3Z1D3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
3425401B19RikD3Z1D3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms