Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif28pD3YXS5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms