Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms