Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rexo5D3YW29 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rexo5D3YW29 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms