Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms