Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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