Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms