Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms