Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms