Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn7aB1AYL1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms