Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms