Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr2B1AVP0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms