Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700084M14RikB1AT01 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700084M14RikB1AT01 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms