Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms