Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms