Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms