Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 642.1 ms