Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms