Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Syndig1A2ANU3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms