Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc163A2AGD7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms