Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhbdl2A2AGA4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhbdl2A2AGA4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhbdl2A2AGA4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rhbdl2A2AGA4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms