Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc27A2A6Q5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms