Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc112A0AUP1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc112A0AUP1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc112A0AUP1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc112A0AUP1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms