Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms