Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2210011C24RikA0A087WQ89 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2210011C24RikA0A087WQ89 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms