Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit3W8DXL4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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