Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3550W4VSN7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms