Protein–RNA interactions for Protein: S4R2D1

Gm5493, Predicted gene 5493, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5493S4R2D1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5493S4R2D1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5493S4R2D1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms